Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Klc3Q91W40 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klc3Q91W40 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms