Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp3Q91W36 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp3Q91W36 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms