Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crb1Q8VHS2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Crb1Q8VHS2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Crb1Q8VHS2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.3 ms