Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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