Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Med17Q8VCD5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Med17Q8VCD5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms