Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MpdzQ8VBX6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MpdzQ8VBX6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 405.2 ms