Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms