Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc58Q8R3Q6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms