Protein–RNA interactions for Protein: Q8K441

Abca6, ATP-binding cassette sub-family A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca6Q8K441 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abca6Q8K441 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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