Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vrk3Q8K3G5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vrk3Q8K3G5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms