Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdk5rap2Q8K389 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk5rap2Q8K389 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms