Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms