Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SrrdQ8K2M3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrrdQ8K2M3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms