Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc12Q8K2L8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms