Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brd3Q8K2F0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Brd3Q8K2F0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms