Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cnppd1Q8K158 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cnppd1Q8K158 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Cnppd1Q8K158 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cnppd1Q8K158 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1Q8K158 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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