Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nupl2Q8CIC2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nupl2Q8CIC2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms