Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Setd1bQ8CFT2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Setd1bQ8CFT2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms