Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slfn5Q8CBA2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms