Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf21bQ8C966 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms