Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn5Q8BXA0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms