Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sall4Q8BX22 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms