Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtpaQ8BWP5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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