Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan9Q8BJU2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms