Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc38a9Q8BGD6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc38a9Q8BGD6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms