Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trmt12Q8BG71 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms