Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sv2bQ8BG39 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms