Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Jmjd4Q8BFT6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms