Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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