Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TnnQ80Z71 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnnQ80Z71 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TnnQ80Z71 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TnnQ80Z71 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnnQ80Z71 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnnQ80Z71 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TnnQ80Z71 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnnQ80Z71 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TnnQ80Z71 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms