Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrfn4Q80XU8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrfn4Q80XU8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lrfn4Q80XU8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lrfn4Q80XU8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lrfn4Q80XU8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Lrfn4Q80XU8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrfn4Q80XU8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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