Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc1Q80VQ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc1Q80VQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms