Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll4Q80V24 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms