Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atf7ipQ7TT18 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms