Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms