Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sbno2Q7TNB8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sbno2Q7TNB8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sbno2Q7TNB8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sbno2Q7TNB8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno2Q7TNB8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sbno2Q7TNB8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms