Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms