Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd3eapQ76KJ5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms