Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SynmQ70IV5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SynmQ70IV5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SynmQ70IV5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SynmQ70IV5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SynmQ70IV5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SynmQ70IV5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms