Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sned1Q70E20 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sned1Q70E20 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sned1Q70E20 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms