Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms