Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Glis3Q6XP49 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Glis3Q6XP49 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms