Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl3Q6W5C0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms