Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88cQ6VGS5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms