Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc9c1Q6UJY2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc9c1Q6UJY2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms