Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc57Q6PHN1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms