Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms