Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms