Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms