Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC061212Q6P8K3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC061212Q6P8K3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms