Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx4Q6P1D7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms